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基于网络药理学和分子对接的扶正固本颗粒治疗胃癌机制研究
  
DOI:
中文关键词:  网络药理学  分子对接  扶正固本颗粒  胃癌  
英文关键词:
基金项目:国家自然科学基金项目(编号:82074284);
作者单位
耿艺菲1 黄志鸿1 洋雯茜1 藏晨晨1 尹纪元1 蔡永铭2 刘勇国3 吴嘉瑞1 1. 北京中医药大学中药学院 2. 广东药科大学医药信息工程学院 3. 电子科技大学信息与软件工程学院中医知识与数据工程实验室 
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中文摘要:
      摘要:目的:应用网络药理学和分子对接方法探究扶正固本颗粒治疗胃癌的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMID、OMIM、DigSee等数据库获取扶正固本颗粒中的活性成分和潜在靶点以及胃癌相关人类靶点。取两者交集靶点导入STRING中进行蛋白互作分析,得到的数据导入Cytoscape 3.8.0用MCODE插件进行模块分析,并筛选出代表性的靶点通过R studio等软件进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。用Cytoscape 3.8.0构建"活性化合物-作用靶点"、"中药-化合物-核心靶点-通路"等网络。最后选取核心靶点与对应化合物进行分子对接。结果:筛选出扶正固本颗粒共174个活性化合物和1 032个作用靶点,胃癌共5 276个作用靶点,两者交集靶点共607个。核心靶点涉及蛋白激酶B(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、信号传导与转录激活因子3(STAT3)、磷脂酰肌醇-3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、血管内皮生长因子A (VEGFA)。GO和KEGG富集分析结果显示,扶正固本颗粒治疗胃癌主要与化学反应、对有机物的反应、细胞对化学刺激的反应等生物过程有关,作用靶点主要集中在癌症通路、PI3K-Akt信号通路、癌症中的蛋白多糖通路等。分子对接结果显示核心靶点与对应化合物的最低结合能均小于-5.0 kcal·mol-1。结论:扶正固本颗粒治疗胃癌的作用机制可能与PI3K-Akt信号通路以及AKT1、TP53、MAPK1、PIK3CA、STAT3、PIK3R1、SRC、VEGFA密切相关。
英文摘要:
      
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